1999年1月10日经黑龙江省人民政府公布为省级文物保护单位。清代建筑。位于依兰县依兰镇西南,始建于清顺治十二年(1655年,乾隆二年(1737年建成。由官府和当地穆斯林集资兴建,历时八十余年,是依兰县建造最早、保存较完整的古建筑群。该寺坐西朝东,建筑东西走式,占地面积3560平方米,建筑面积628平方米,有门殿、影壁、正殿和南北讲堂。殿堂为砖木单檐硬山式结构,屋脊两侧有花瓶、鲤鱼卧莲等伊斯兰文化图案。影壁由青砖雕砌而成。依兰清真寺建筑布局严整、雕刻工艺精湛。
整座寺院共有房屋21间。 正殿为招梁硬山、四柱三间、一脊一卷式构造,屋顶防水为青筒瓦,正脊卷尾大龙头吻、四大吞脊兽,屋脊挺拔素美,戗脊八个蹲脊兽,三十二个小麒麟兽头,大殿屋顶组合是愈后愈高的气势。
正殿前与卷棚廊相接,两大金柱把棚廊分为三间,每间3.6米,阑额与平板坊分开,阑额下金柱间安装有木雕暗八仙雀替。檐口下阑额上雕有钳口,中为荷叶墩,廊檐宽2.2米,廊壁为花式砖雕。卷棚廊屋脊偏前,斗拱粗大,梁坊等木构件均施清式点金彩绘图案,充分显示了正殿的高大雄伟气势。
正殿(礼拜殿为整座建筑的主体部分,规模宏大,空间宽敞,殿门有童柱分为三樘,每樘安置券门六扇,通开间十八扇,均为条框式木雕,雕有梅兰竹菊、轮螺伞盖、花瓶鱼虫,券门上走马板多施伊斯兰风格绘画,上方挂有两块清朝官员所赠匾额,一块是三姓副都绝亲提赠“桓古清真”(此匾毁于文革期间,一块是奉天提督左宝贵和管带王德林敬献的“开天古教”匾额。
正殿屋顶木架结构,五檩五鸠,天棚木板,方头椽子,六大童柱矗立殿中。圣龛、悯素尔和棺罩为当地红松制造,雕刻精美,工艺精湛。
南北两山硬山列顶,立陡檐顶、砖雕锤挂,两山升悬山砖雕券窗,为条框式雕砖窗扇,雕有吉祥如意、鹤鹿同春、吉庆有余、蝙蝠流云、云龙戏水、百年合好等。戗檐、墀头处饰以精美的砖雕和伊斯兰经文,清砖均磨边对缝,高贵典雅,体现了伊斯兰文化融入中国古建筑营造法式之中。
门殿防水青筒瓦,屋脊两侧砖雕有花瓶,中间为鲤鱼卧莲。屋顶六檩六鸠,天棚朳板,方头椽子,廊檐建造与正殿相似。中间寺门,上挂“清真寺”匾额。门前南北两侧有雕花门转木鼓一对,前壁两侧为圆形六密式鸡爪木窗,门殿后为一影壁,飞檐并镶嵌花式砖雕,磨砖对缝,建造精细。
南北讲堂为普通式廊檐砖瓦结构,南北对称排列,山檐、埋头饰以砖雕。花圃甬道、六角邦克亭坐落院中,亭边竖有一高20米的月牙杆。正殿后建有高14米的望月楼。
寺内现藏有龙凤棺罩、经书、牌匾等文物。相传,龙凤棺罩是乾隆皇帝为答谢清真寺回民救命之恩所赏赐,距今己有近三百年的历史。
如今,依兰清真寺以其古朴、典雅的原始风貌成为依兰县一处独具特色的人文景观。