舍利塔位于栖霞寺藏经楼南侧。相传隋文帝曾遇神尼，得舍利数百颗。登基后有意重兴佛法，乃两次下诏，要天下八十三州各选一有山水之寺或清静寺院建舍利塔。并派高僧等分道将舍利子送往各地置于塔。特诏令首先送往蒋州(隋时南京为蒋州)栖霞寺，舍利塔由此而建。
隋时，原塔系一座木塔(隋文帝仁寿元年公元601年建成)，因岁月剥蚀而毁。至南唐时，佛教又兴，南唐杰出文化名人高越和林仁肇主持重修栖霞寺时兴工重建，成为今日仿木结构的石塔。高越为之写了《舍利塔记》一卷。死后亦埋葬在寺院山外的坡地上。
舍利塔系石塔，规模虽不大，但造工十分精致，由各种不同形状的石灰岩与大理石相结合垒砌而成。其结构采取先制就所需石料配件，然后接榫安装，精密稳固，虽历经千年风雨兵燹而依然完好。舍利塔为八面五级，连基座共七层，高18.04米，构筑别致。由塔基须弥座以及五层密檐式塔室构成。
塔基有上下两层：第一层雕刻缠技莲纹，第二层镌刻飞凤、莲花等图案。塔基之八面刻有海水纹，并雕有龙、凤、鸟、兽、鱼、虾、蟹、鳖等图案；或腾云驾雾；或出没山林；或沉浮波涛。形象姿态、十分逼真。须弥座为仰莲花座，上为束腰基坛，角柱上各雕金刚、力士、立龙、怪兽，以承塔身。基坛八面浮雕刻有释迦牟尼八相成道图，依次为托生母胎、树下诞生、逾城出家、雪山苦行、降伏魔军、树下成道、鹿苑说法、鹤林入灭等。这些雕刻用艺术手法展现释迦牟尼佛富有传奇的一生，每幅画面的构思都富有想象力，人物情态、刻画逼真、服饰器具、山川树木等背景安排得巧夺天工，十分得体。这一组浮雕能体现舍利塔的宗教功能。须弥座与塔身之间，雕以莲花露盘三叠，花瓣上阴刻宝相花纹，体现出我国传统图案艺术特色。
塔身由五层密檐式塔室构成：第一层塔室。八面刻有雕像。第一、三、五、七面为四大天王像。(天王则披甲执戈，形象威严。并刻有雕刻者姓名：王文载、丁延规、徐知廉)第二面为普贤骑象，第四、八面为版门(门作紧闭状，门上有铺首及门钉)，第六面已经毁去，根据考证，此面应为文殊像。第二层到第五层塔室。四层八面每面均雕两石龛，每龛中坐一佛，共计刻有六十四尊小佛像，象征着千佛世界。塔顶密檐成筒瓦状，叠石六重饰以莲瓣、束缨、云纹，意为覆钵相轮和火珠。
民国初年，由叶恭绰主持、刘敦桢设计，对舍利塔进行了重修，现塔顶上的相轮，为当年仿北魏云中寺补建，塔前旧有引接佛二尊，也在当年移到塔东的三圣殿前。一九九三年，国家文物局对舍利塔进行了维修，此次将掉落在周围的八大块石构件粘接到原断口处，对塔身及塔檐的裂缝，用环氧树酯及其他化学粘接剂勾缝补平，本着修旧如旧的原则，保持了原有的南唐建筑风格。 舍利塔代表了南唐时代雕刻艺术的最高水平，它上承隋唐佛教艺术精神，下开宋元佛教艺术的先河。在中国佛教建筑史和雕刻史上占有重要地位。一九八八年列为第三批全国重点文物保护单位。
