美龄宫是南京东郊最美的建筑之一。1929年6月1日，宋美龄随蒋介石一起参加孙中山先生的奉安大典，见明孝陵四方城东边的小红山一带山河苍茫，林海浩瀚，环境清幽，就要求蒋介石在这里建造别墅，可供两人去谒陵时半道休息小雅。这个主张正合蒋介石的心意。紫金山又名蒋山，在蒋山建造别墅，国姓蒋，党姓蒋，山姓蒋，别墅也姓蒋，正是天造地设，天巧地合。1930年秋，蒋介石正式对总理陵园管理委员会提出：“拟借陵园小红山建筑别墅”。这无疑是个“圣旨”，下属当然卖力。1930年10月24日，陵园管理委员会召开第24次会议，由孙科主持，议决“照办”。于是从1931春开始，由南京市府工务局局长赵志游亲自设计，技正陈品善负责主办，所有工程计划、预算及招标订约等事，均由陈品善会商工务局局长办理。整座建筑由新金记康号营造厂负责承造，当时预算造价为261410元。3月7日，工务局长赵志游写信给总理陵园管理委员会说：“主席小红山官邸业经敝局计划就绪，亟待兴工，所有该处基地内房屋自应先行拆除，以利进行，相应函达，请烦转函贵会警卫处迅饬现住小红山房屋之一部分警卫即日迁移，以便拆除兴工。”陵管会随即令饬警卫处将小红山警卫迁移。1931年冬，官邸工程全面铺开。

美龄宫是一座依山而筑的中西合璧式建筑，四周花木扶疏，郁郁葱葱，占地120亩，由正屋、门楼、警卫室、汽车间及花园等数部分组成。落成后的美龄宫是一幢中国宫殿式大屋顶建筑。正屋即主体建筑耸立在小红山山顶，高大而巍峨，极富民族气韵。巨大的古典式屋顶上，覆盖着绿色琉璃瓦，在阳光的映照下，流光溢彩，耀人眼目。据说工笔画家陈之佛曾为其内部装饰出谋献策，别墅南裙裙檐天花板上那蓝底云雀琼花图案也被认为是陈之佛先生的杰作。主体建筑二千余平方米，主楼为地下室一层，地面三层。地下室的东部为职员用房，西部为厨房。地面第一层有接待室、衣帽间、秘书办公室及卧室、厨房、配膳房、洗衣室、卫生间、服务用房等。第二层主要作会客室与休息室之用，设有大厅、客厅、大饭厅、配膳房、书房、秘书室等。通过大厅，可以至“凸”字形平台，平台四周围以清式汉白玉雕凤栏杆，显得雍容华贵，富丽堂皇。大阳台场地开阔，可供露天活动与茶饮之用，也是欣赏自然景观的最佳之处。值得一提的是，平台雕凤栏杆共有34根，每根立柱上各雕凤凰一只，象征别墅的女主人。宋美龄自1897年出生至1930年提议建造这座别墅正是34周年，34只凤凰即寓此意。第三层为居住部分，高有女客厅、四间大卧室及小餐厅、厨房等。室内陈设考究，地上铺有紫红色地毯，墙上挂着名人字画。客厅后来改为祈祷室，即凯歌堂。每逢星期日上午，蒋氏夫妇同政府高级官员中之基督徒们一起做礼拜。美国驻华大使司徒雷登、马歇尔夫妇也曾到凯歌堂做礼拜，有关经济援助、协议、与共产党谈判的对策等，就在礼拜前后商定。

整座建筑，因过于富丽堂皇，建筑过程中经费大大超支，受到舆论的非议，以致一度停建，直至1934年才告竣工。

美龄宫最早的名称是“蒋主席小红山别墅”，后称为“南京主席公邸”、“主席小红山官邸”、“主席小红山公邸”、“国民政府主席官邸”等。因三四十年代宋美龄经常在这里做礼拜，不时同蒋介石在这里下榻、休息，而有好事者便称之为“美龄宫”，遂辗转相称沿用至今。“文化大革命”期间，为避讳“美龄”之名，曾将附近的公交汽车站“美龄宫”改为“梅岭宫”。直至80年代初期，才又恢复“美龄宫”的名称。

前些年，白崇禧之子、台湾作家白先勇先生参观完美龄宫后，回忆起当年宋美龄的绰约风姿，对比眼前的物是人非、人去楼空的景象，不禁发出了“宫花寂寞红”的感慨。

1991年，美龄宫被国家建设部、国家文物局评为近代优秀建筑。1992年，被列为南京市文物保护单位。2001年7月，又被列为全国重点文物保护单位。