扬州医学院、江苏水利工程专科学校、江苏商业专科学校等6所高校合并组建而成。江泽民同志为学校题写校名，李岚清同志先后三次视察学校，教育部、江苏省的领导同志多次莅临学校指导工作。扬州大学的办学历史最早可以追溯到1902年由近代著名实业家、教育家张謇先生创建的通州师范学校和通海农学堂（后成为南通学院的一部分）。原江苏农学院和扬州师范学院便是在南通学院农科和通州师范学校文史科的根基上发展起来的。参与合并的其他4所高校也均有50年以上的独立办学历史。
扬州大学办学规模较大，学科门类齐全。全校现有普通全日制本、专科生27700多人，博、硕士研究生2500多人，成人学历教育学生20000多人。现设有文学院、社会发展学院、政法学院、教育科学与技术学院（师范学院）、外国语学院、数学科学学院、物理科学与技术学院、化学化工学院、体育学院、机械工程学院、信息工程学院、水利与建筑工程学院、环境科学与工程学院、农学院、畜牧兽医学院、生物科学与技术学院、医学院、商学院、旅游烹饪学院（食品科学与工程学院）、艺术学院和公有民办的广陵学院等21个学院，87个本科专业，涵盖哲学、经济学、法学、教育学、文学、历史学、理学、工学、农学、医学、管理学等十一大学科门类。
学校师资结构合理，综合实力较强。全校现有教职工4200多人，其中专任教师2000多人，教授、副教授近900人，享受政府特殊津贴97人，国家级、省级有突出贡献中青年专家29人，博、硕士生导师400多人。作为全国首批博士、硕士学位授予单位，学校现有3个博士后流动站、13个博士点、70个硕士点（含4个专业学位硕士点）;拥有1个国家级重点学科，7个部、省级重点学科，6个部、省级重点实验室，1个省工程技术研究中心，1个省级研究院，72个科学研究机构，39个教学实验中心（室）。学校目前承担各级各类科研项目800多项，全校年科研经费6100多万元。2001年，学校获国家自然科学基金项目20项，总经费305万，位居全国高校前40名，江苏高校前4名。2002年，学校获国家自然科学基金面上项目21项，参加重点项目3项，立项课题数和科研经费数均创历史新高；获国家社科基金项目5项，立项数并列全省高校第二位。“九五”以来，共有280多项科研成果获省部级以上奖励，取得了一批高水平的科研成果。其中，由中科院与我校共同完成的“转基因山羊体细胞克隆山羊”成果被评为1999年中国基础研究十大新闻之首，由我校参与完成的“水稻第四号染色体精确测序”工作被评为2002年中国十大科技进展头条新闻。科技开发与成果推广成绩同样喜人，学校与响水、高邮、泰兴等地建立的“产学研联合体”，在推进“农科教三结合”转化方面走出了一条成功之路。
学校办学条件优良，对外交流活跃。校园占地面积4500多亩,校舍建筑面积120多万平方米。8个校区位于市区中部，首尾相连，构成蔚为壮观的大学城。全校固定资产总值8亿多元，教学仪器设备总值1.8亿元，图书馆藏书290多万册。拥有实验工厂、实验农牧场、动物医院、附属中学、附属小学等一批教学、科研和实习基地，并有4所设备完善的临床医学院。学校注重开展国际学术交流活动，先后与10多个国家和地区的高校（研究机构）建立了合作交流关系。学校具有招收外国留学生（包括接受政府奖学金外国留学生）和招收港、澳、台本科学生的资格。
合并办学10多年来，学校走过了一条“联合—合并—调整—提高”的改革发展之路。建校之初，我们走的是联合办学的道路；从1995年上半年起，学校由松散型联合转变为实质性合并。1998年，学校按学科群重组了15个二级学院，实行“校院系三级建制、校院两级管理”的管理体制。2002年 后，基于学科建设需要的原则，学校又进行院系的局部重组学院数由原来的15个增加至21个，内部管理体制从校院系三级管理向校院两级管理过渡，减少了管理层次，提高了管理效益，为学科、专业建设创造了更为有利的发展空间。
2002年是学校合并办学10周年、在扬办学50周年、建校100周年。学校成功举办了系列庆祝活动，建立了校友会和董事会，达到了“回顾历史、总结经验，外塑形象、内聚人心，集思广益、促进发展”的目的 。彭珮云、许嘉璐、钱伟长等党和国家领导人以及教育部、江苏省四套班子的主要领导出席了庆祝大会。中共中央政治局委员、国务院副总理、原江苏省委书记回良玉同志在讲话中指出：“扬州大学是省委、省政府重点建设的3所省属地方综合性大学之一，省委、省政府将一如既往地给予关心和支持”。国务委员、原教育部部长陈至立同志在宣读的贺信中指出：扬州大学“六校合并，开创了我国高校管理体制改革的先河”。 承传历史辉煌，谱写改革华章。已有百年办学历史的扬州大学，在合并办学的改革中，敢为人先，开拓进取，为我国高等教育管理体制改革提供了有益的经验，被中央领导同志誉为“高校改革的一面旗帜”。面向未来，扬州大学确立了建成“国内有地位、国际有影响的高水平地方综合性大学”的目标，提出了实现办学目标的总体思路，即围绕“发展”这一主线，狠抓“教育质量和办学效益”两个重点，处理好“巩固成果与深化改革、规模拓展与内涵建设、教学科研与社会服务”三对关系，大力实施“名师与品牌、交融与创新、超前与跨越、开放与合作”四大战略。在新的征程中，扬州大学将以党的十六大精神和 “三个代表”重要思想为指导，与时俱进，锐意创新，阔步迈向更加辉煌的明天！
