吉林医药学院创办于1952年，原为中国人民解放军第四军医大学吉林军医学院，曾是一所具有光辉历史和优良传统的军队医学院校。经国务院、中央军委批准，学院于2004年8月整体移交吉林省管理，纳入国家普通高校序列，面向全国招生。全日制在校生定额 10000 人。2004年已面向24个省招收新生1600人。
　　学院位于中国十大魅力城市之一的北国江城--吉林省吉林市，美丽的松花江呈“S”形流经市区，四面环山、三面临水，风景秀丽，吉林雾淞与云南石林、桂林山水和长江三峡并称为中国四大自然奇观。
　　学院占地面积70.8万平方米，建筑面积35.6万平方米。固定资产总值4亿元。教学用房13.5万平方米，所有教室均为现代化多媒体教室，学院全部实现了多媒体教学。学院设有学术交流中心，可容纳学生6000多人。学院建立了完备的校园网络，园区主干网为千兆快速以太网，互联网接入办公区和学生宿舍，实现了教学、办公网络化。
　　学院现设置9个本科专业：临床医学、预防医学、生物医学工程、公共事业管理、药学、药物制剂、医学检验、医学影像学、护理学；8个专科专业：临床医学、营养与食品卫生、药学、医学检验技术、放射技术、医学生物技术、护理学、口腔医学。有6个一级学科：预防医学、临床医学与医学技术、口腔医学、护理学、药学、公共管理学；9个二级学科：营养与食品卫生、临床医学、医学检验、医学影像学、医学实验技术、口腔医学、护理学、药学、公共事业管理。学院有军队重点学科2个：解剖学与组织胚胎学、药剂学；军队级重点实验室2个：生物化学实验室、生理机能实验室。
　　学院有一支以博士、硕士为骨干的专业师资队伍，结构合理，事业心强，教学、医疗、科研能力突出。有高级专业技术职务130人，具有博士、硕士学位162人，研究生导师31人。享受国务院特殊津贴2人；吉林省有突出贡献的中青年专家1人；有13人次先后被评为全国、全军优秀教师，7人次获解放军育才奖 。在国家二级学术机构担任理事以上职务23人。
　　学院始终以教学内容改革为重点，以学科建设为基础，以师资培养为关键，以提高人才培训质量为核心，坚持立足基层，办出特色的办学指导思想，注重体现专业和层次特色。注重培养“厚基础、宽口径”的复合型人才。
　　学院由部队转隶地方后，对学生的管理继承并发扬了军队院校的优良传统，坚持以人为本，为学生服务；坚持教书育人，使学生成才；坚持严格管理，让家长放心。学院实行专任辅导员管理制度，挑选责任心强、专业基础扎实的教师任各期班辅导员，24小时跟班作业，为学生学习、生活提供指导和帮助。
　　学院坚持教学、医疗、科研相结合，科研工作近几年取得了显著进展，具备了较强的学术发展和科研实力。先后完成国家、军队重点课题86项。获得军队科技成果奖和科技进步奖574项，其中国家发明奖1项；国家科学技术进步二等奖1项；国家专利38项。国家和军队各类教学成果奖40项。在省级以上刊物发表论文6000余篇。
　　学院拥有一流的文化体育设施。建筑面积为4910平方米、能容纳3600余人的综合性文体活动中心，功能齐全，设施先进。除可开展球类比赛、文艺演出、大型集会等活动外，还建有1个6靶位的标准室内射击场以及乒乓球馆、健身房、棋牌书画室等。大型体育场占地面积4万平方米，设有标准化的田径运动场、足球场、篮球场、排球场、网球场、冰球场等，可满足体育课教学和举办大型运动会的需要。
　　附属医院是一所集医疗、教学、科研、预防、保健为一体的综合性三级甲等园林式医院，展开床位500张。拥有磁共振（MRI）、数字减影血管造影机（DSA）、多排螺旋CT、DR数字摄影机、数字化胃肠机、彩色超声、全自动生化分析仪、高能聚焦超声刀等大型先进仪器设备。
　　校园环境优美，生活设施配套齐全。绿化面积达40万平方米，绿地面积3.15万平方米，2004 年学院被评为全国绿化模范单位。现代化的学生公寓楼、综合性学生餐厅、功能齐全的商务中心等，为学生提供了优质、舒适、方便的学习环境。
　　目前，学院正抓住高等教育大发展的历史机遇，不断拓展办学的新领域、新层次、新空间，加快学院的建设和发展步伐。学院在整体移交的2004年，就开工建成了可容纳1700人的学生公寓楼；同时开工新建的另一栋学生公寓楼和建筑总面积为17000平方米的新教学楼、48000平方米的新实验楼也将于2005年全部竣工，投入使用。