建校近50年来，为国家培养和输送了各级各类中医药专门人才，校友遍布60多个国家和地区。学校拥有600多名专家和教授。有院士、全国名中医、国家级重点学科带头人等。全校系统在职教职工4449人（包括附属单位）。
学校现有16个二级学院及部门。3所直属附属医院，曙光医院、龙华医院、岳阳中西医结合医院，均为三级甲等医院。1个E-研究院。12个附属及共建研究所。8个研究中心。另外还成立了由上海17家中医机构组成的医教研联合体。3个教育部基地：中国大学生武术训练基地、国家大学生文化素质教育基地、国家理科基础研究和教学人才培养基地；3个一级学科授权的博士点：中医、中药与中西医结合学科，同时也都是博士后流动站；15个二级学科博士点；23个硕士点；24个本、专科专业（方向）；同时，学校还有7个继续教育的本、专科专业。
目前，学校各类在校生有5700余人，其中博士生280余人、硕士生580余人、本专科生（包括高职）3850余人，成人教育500余人，长期外国留学生440余人。除上海生源外，学生还来自全国各个省市，其中台港澳学生230余人。另外，目前学校已与14个国家和地区建立了合作关系，有来自日、韩、俄、法、英、美、德、意等30余个国家和地区的短期留学生每年600余人次。外国留学生规模居上海市高校前列。
我校实行研究院与学校合署的管理体制，上海市中医药研究院是全国七大中医药研究中心之一。学校现有国家教育部重点学科3个：中医外科、中药学、中医内科。国家中医药管理局学科建设单位4个。上海市重点学科2个。上海市教委第四期重点学科3个。上海市重点实验室1个。国家中医药管理局重点实验室3个，三级实验室14个。
学校的办学目标是朝着高层次、研究型、外向型方向不断努力，建成为国内一流、世界著名的中医药大学。
