古尔班通古特沙漠于北纬44°15′～46°50′，东经84°50′～91°20′。是中国第二大沙漠。玛纳斯河以东及乌伦古河以南地区，位于准噶尔盆地的中央，面积4.88万平方公里。海拔300～600米。由4片沙漠组成,西部为索布古尔布格莱沙漠，东部为霍景涅里辛沙漠，中部为德佐索腾艾里松沙漠，其北为阔布北—阿克库姆沙漠。
    准噶尔盆地属温带干旱荒漠。 年降水量70～150毫米，沙漠内部绝大部分为固定和半固定沙丘，其面积占整个沙漠面积97％，形成中国面积最大的固定、半固定沙漠。固定沙丘上植被覆盖度40～50％，半固定沙丘达15～25％，为优良的冬季牧场，沙漠内植物种类较丰富，可达百余种。植物区系成分处于中亚向亚洲中部荒漠的过渡。沙漠的西部和中部以中亚荒漠植被区系的种类占优势，广泛分布以白梭梭、梭梭、苦艾蒿、白蒿、蛇麻黄、囊果苔草和多种短命植物等；沙漠西缘有甘家湖梭梭林自然保护区，为中国唯一以保护荒漠植被而建立的自然保护区面积上千公顷。 

    垦区农牧场呈带状分布在沙漠南缘。其中北塔山牧场,红旗、一○七、土墩子、一○二、一○三、芳草湖、一○六、新湖等团场的耕地已延伸到沙漠内部。一○二团场、一○三团场是从自治区首府乌鲁木齐进入古尔班通古特沙漠腹地最近的通道。绿色沙漠通道以五家渠为起点,东线从一○二团场17连出绿洲,西线经一○三团场14连进入沙漠,长约60千米,终点到准噶尔盆地的“罗布泊”东道海子、白家海子。这条通道上,绿洲与沙漠犬牙交错,形成独特的自然人文景观。